肾囊肿尿毒症最有效方法是肾移植。但由于供体的缺乏，肾移植无法发挥其应有的治疗作用，因此绝大多数尿毒症患者需要长期维持性血液透析或腹膜透析治疗。肾脏替代治疗的目的是延长寿命，提高尿毒症患者的生活质量并促进康复与回归社会。无论是血透还是腹透都只能代替肾脏的清除代谢废物，维持水电解质酸碱平衡的作用，而无法替代肾脏的另外一个重要功能及内分泌功能，所以说尿毒症患者是不可治愈的。
肾囊肿尿毒症属于晚期的症状，一般来说可以用药物进行控制，但是不能痊愈，需要终身服药，避免病情反反复复发作，伤害身体，还有人甚至需要换肾，这个比较麻烦，患者还需要听从医生的建议，注意万物由心生，好的态度，积极地心态是很重要的。态度决定了一切，有好的心态可以让病情好的快一点。