三氯异氰尿酸是否有毒需要根据其中所含的有效氯含量决定，如果其中有效氯的含量比较低则没有毒，如果其中的有效氯含量较高则是有毒的。
三氯异氰尿酸为白色结晶性粉末或粒状固体，是一种极强的氯化剂和氧化剂，具有高效、广谱、安全等特点，可用于环境、饮水、畜禽饲槽、鱼塘、蚕房等的消毒，其中含有效氯在85%以上属于正常范围，没有毒性，可以正常使用。
但是如果其中含有的有效氯含量比85%高出比较多，则是有毒的，会对人体健康产生一定危害。人体在使用含有高浓度有效氯的三氯异氰尿酸时可能会刺激眼睛、鼻子、喉咙等部位的黏膜，与易燃物、有机物接触还容易着火燃烧。在严重的情况下，对人体呼吸道黏膜和皮肤有明显的刺激作用，大量使用还可能会污染环境。
建议平时避免长期直接接触含高浓度有效氯的三氯异氰尿酸，如果需要接触应该注意做好口鼻防护措施，在使用三氯异氰尿酸消毒时尽量按照说明书进行稀释后再使用。若由于三氯异氰尿酸使用不当导致人体眼睛等部位受到刺激，可到医院普内科就诊，进行问诊、视诊等检查后在医生的指导下进行处理。