水溶性膳食纤维通常包括果胶及树胶等，如果正常适量补充，一般不会对身体造成危害。如果过量摄入，则可能影响消化和吸收，引起腹胀等不适。
水溶性膳食纤维体积较大，可促进肠道蠕动，如果摄入过量，使肠道蠕动过快，食物在肠道内停留时间过短，不利于食物中的营养充分消化和吸收。不仅会降低钙、铁等矿物质及部分维生素的生物利用率，还会使机体热量摄入不足，长此以往，严重者甚至可能会出现营养不良。另外，由于水溶性膳食纤维可吸附水分，尤其是瓜尔豆胶等凝胶性强的膳食纤维，摄入过量后可能会引起大便中水分减少，造成便秘、大便次数少、腹胀等副作用。
适量摄入水溶性膳食纤维可活化肠道中的有益菌，促进其大量繁殖，维护肠道生态健康，还能防止便秘、痔疮等病症。如果患者需要补充水溶性膳食纤维，建议前往专科医院咨询医生后在医生指导下进行适量补充，切勿私自滥补。