肺叶切除对人体导致的最大危害，是由于肺组织减少，肺泡有效面积减少，可能会导致肺组织有不同程度的呼吸功能障碍。由于肺叶切除导致的肺功能障碍，属于限制性通气功能障碍，肺泡的有效面积减少，因此肺叶切除大多数会导致不同程度的限制性通气功能障碍。正常人右肺有三叶，左肺有两叶，任何一叶肺叶切除，都可能导致不同程度的限制性通气功能障碍。
除此以外，在肺叶切除前后可能有各种并发症的发生，尤其是术后的感染，可能会进一步导致肺功能障碍。有些患者术后良好的营养状况，可以进行适当肺功能锻炼。即便可能有不同程度的限制性通气功能障碍，通过适当的锻炼，肺功能得到不同程度的代偿，肺功能损害不一定很严重。有的患者有基础疾病，且年龄大，尤其是本身有慢性肺部疾病的患者，肺叶切除后可能肺功能损害的严重程度会更加明显。