黑毛舌可能是真菌感染、长期吸烟及长期应用抗生素等因素引起，一般是由舌背部丝状乳头过度伸长及延缓脱落长出的毛发状损害导致，治疗时要注意口腔卫生，并及时更换药物。
1、真菌感染：如果存在口腔卫生不洁或是口腔内过于干燥，可导致舌黏膜菌群比例失调，使舌的丝状乳头发生真菌感染，以毛霉菌属的黑根霉菌最常见，会由正常的粉白色舌苔变成黑色，引起黑毛舌症状；
2、长期吸烟：可能会刺激口腔上皮角化增生，并且烟草中含有烟碱类物质容易凝结在牙齿及舌苔上，因此不仅会出现黑毛舌，还会导致牙齿发黑；
3、长期应用抗生素：具体原因上不是很明确，可能会导致口腔内菌群失调，消灭了口腔内能够抑制引起黑舌的某些真菌或细菌，也可成为黑毛舌的病因；
4、食物着色：食用过多含有黑色素的食物，可能也会使舌头染色，而出现黑毛舌症状，此时减少此类食物食用后，可逐渐缓解症状。