灌注化疗与全身化疗的区别有疗效不同、针对疾病不同。化疗是除外科手术外，治疗恶性肿瘤的一种方式，是通过使用化学药物来抑制癌细胞生长，从而控制肿瘤转移和扩散，防止病情加重，治疗效果较好，其中灌注化疗、全身化疗是最常见的化疗方式。
1、疗效不同：通常灌注化疗是通过腹腔灌注化疗和热灌注化疗，通过使用强力化合物来抑制肿瘤细胞生长，从而控制肿瘤细胞的增殖，灌注化疗所使用的药物浓度可以增加10-100倍的剂量，可以有效杀死肿瘤细胞，增加治疗效率。但是全身化疗的药物浓度较低，所用时间也较长，因此相比之下灌注化疗的疗效较好。
2、针对疾病不同：尽管灌注化疗、全身化疗都是针对恶性肿瘤的化疗方法，但灌注化疗更适合肺癌、胃癌、肝癌等恶性肿瘤，而皮肤癌、绒毛膜上皮癌则更加适合全身化疗。
虽然灌注化疗、全身化疗对治疗肿瘤有较好的效果，但选择哪种治疗方式，需到医院肿瘤科就诊，经B超检查、血常规检查等明确病情，遵从医生安排进行治疗。在治疗期间患者要保持良好的情绪，积极配合治疗，有利于病情康复。