苦瓜营养丰富，与其他食物一起食用并不会发生毒副作用而对人体造成伤害，因此苦瓜可以和大部分食物一起食用，并不存在不能一起吃的食物，但尽量避免和热性药物同用。但在食用时也需要注意食用量，过量食用会出现肠胃不适而引起恶心、呕吐等。
苦瓜富含膳食纤维、矿物质、维生素以及苦味素和苦瓜多肽等有益成分，适合大部分人群食用，有利于身体健康。苦瓜的热量低，饱腹感较强，适量食用可减少其他高热量食物的摄入，有利于控制体重，适合减肥人群及高血糖人群食用。苦瓜富含膳食纤维，可促进肠道蠕动，从而在一定程度上预防和缓解便秘。从营养学角度来看，苦瓜营养丰富，与其他食物一起食用，可以为人体提供更为均衡的营养，有利于人体的健康发育，具体食用方式可根据自身喜好进行选择。但是苦瓜性凉，可能不适宜与吴茱萸、小茴香等热性药物同用，否则可能会影响药效。
虽然食用苦瓜有诸多好处，但效果有限，不能代替药物作用，如需治疗疾病，建议前往医院就诊并遵医嘱服用药物进行治疗。还需注意的是，肠胃功能较差的人群或是患有消化系统疾病的人群应减少苦瓜的食用量，以免引起腹泻、腹痛等肠胃不适或加重病情。