检查核酸是为了明确是否有某种病原微生物的感染，核酸是病原微生物的遗传序列，不同的病原微生物遗传序列有所差别。因为某一种病原微生物都有独特的遗传序列，一般采取这种独特的，能够区别于其他的病原微生物的，这一段遗传序列进行核酸检测。如果检测出核酸阳性，就能够证明某种病原微生物的感染，所以对于临床的诊断具有很重要的意义。一般病原微生物感染之后在1-2天，核酸检测就可以出现阳性，所以对于早期诊断有很重要的意义。
当然核酸检测也有一些影响因素，比如检测的部位、检测标本的数量、采集的标本是否合格、所用的检测试剂盒是否敏感等因素，都会影响到核酸检测的结果。但一般情况下重复检测在很大程度上都能够帮助临床确定诊断，所以病原微生物核酸检测对于临床诊断某种病原微生物的感染非常有意义。