体内的蛋白质具有多方面的重要功能，首先蛋白质是组织细胞的主要成分，因此参与构成各种组织细胞是蛋白质最重要的功能，机体只有不断的从膳食中摄取足够量的优质蛋白质，才能维持组织细胞的生长、更新和修补的需要。对于处于生长发育时期的儿童以及康复期的病人，尤为重要。蛋白质具有众多特殊功能，比如酶、蛋白质类激素、抗体和某些调节蛋白、骨骼肌的收缩、物质的运输、血液的凝固，都是由蛋白质来实现。
此外氨基酸代谢过程中也会产生胺类、神经递质、嘌呤、嘧啶等重要的含氮化合物，蛋白质和氨基酸的这些功能并不能由糖和脂类代替，因此蛋白质是整个生命活动的重要物质基础。蛋白质可以作为能量物质的氧化供能，1g蛋白质在体内氧化分解，可以释放4000卡能量，一般成人每天约18%的能量从蛋白质获得，但是蛋白质的功能可由糖、脂肪代替，因此供能是蛋白质的次要功能。
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