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1目前我们经常使用而且比较安全的方法就是激光去除，这对于治疗扁平疣的效果非常好。由于扁平疣病毒是在表皮下面，激光只能铲除表面扁平疣颗粒，而皮下病毒没有铲除，所以不可能起到根本的治疗作用，即使当时铲除了，往往过了几个月扁平疣还会重新发出来。
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2如果患者不愿意做手术治疗的话，也可以采取中药治疗，它可以合理的调理患者的身体。由于从口服到内脏吸收到达皮肤，药力损耗大，这种口服中药运用扶正祛邪的原理，不是直接杀灭病毒，所以效果并不理想，并且要长期连续服用几十天，一般人很难坚持。
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3除了以上两种治疗方法外，我们还可以采用西医的治疗方法，它在治疗这个病的时候主要注射转移因子等激素来提高人体免役功能。由于这一种间接性治疗不是直接能杀灭扁平疣病毒，所以治愈率也很低，特别是对一些年龄偏高的人。
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在日常生活中我们要注意个人的生活习惯，饮食方面要均衡，生活要有规律。另外，在治疗期间也要注意日常的护理。