慢性肝炎能够治疗，部分患者能够彻底治愈，部分不能够完全治愈，但可以控制病情，延缓疾病进展，防止进展为肝硬化或发生肝癌。如果为甲型肝炎或戊型肝炎，通常没有慢性期，经过急性期感染都可以达到临床治愈。
慢性肝炎最常见的是乙型肝炎，乙型肝炎患者若有肝功损伤，或者出现肝硬化等表现，病毒复制量超过一定指标，需要抗病毒治疗，可以选择干扰素或核苷类药物口服治疗，通常疗程较长，但可以控制病情，延缓疾病进展。丙型肝炎大多数也会发展为慢性肝炎，目前丙肝治疗有小分子药物抗病毒治疗，可达到95%以上临床治愈率，而且疗程比较短，一般三个月疗程即可。其他自身免疫性肝炎也有药物可以控制，但通常不能完全治愈。