阿莫西林胶囊主要是作为一种广谱抗生素，适合用于各种敏感致病菌导致的感染，如溶血性链球菌、肺炎链球菌、葡萄球菌、流感嗜血杆菌导致的中耳炎、鼻窦炎、咽炎、扁桃体炎等上呼吸道的感染。
对大肠埃希氏菌、奇异变形杆菌或粪肠球菌，导致的泌尿生殖系统的感染有效。对溶血性链球菌、葡萄球菌、大肠埃希氏菌所导致的皮肤软组织的感染有效，还对溶血性链球菌、肺炎链球菌、葡萄球菌、流感嗜血杆菌，导致的急性支气管炎、肺炎等下呼吸道感染有作用。另外，对急性单纯性的淋病有效，本品还可以用于治疗伤寒、钩端螺旋体。阿莫西林如果和克拉霉素等联合用药，还可以治疗幽门螺杆菌阳性，降低消化道溃疡的复发率。