甲钴胺是维生素B12的衍生物，是一种辅酶B12，重点在辅酶比B12更容易进入神经，对神经组织具有良好的传递性，以便于发挥作用。甲钴胺的副作用主要是有些患者服用后会出现过敏症状，有时候会出现皮疹、面色红肿，当出现后需要停止用药。部分病人会出现食欲不振、恶心、呕吐、腹泻，极少数人出现周围性水肿、低血压、晕厥。
此外，长期服用甲钴胺可能引起低血钾、高尿酸血症而诱发痛风患者发病，甲钴胺本身含有金属元素钴，其主要成分的化学结构式里还有甲钴酰胺，它有可能与汞产生化学反应，所以长期接触汞等化学元素的人不易长时间使用。如果口服甲钴铵有效可连续服用半年，但尽量不要长期服用。