甘氨酰脯氨酸二肽酶在医学上一般指甘氨酰脯氨酸二肽氨基肽酶，主要存在于肝脏、肾脏、结缔组织、血清、唾液腺当中，甘氨酰脯氨酸二肽氨基肽酶偏高说明可能有肝胆疾病、肾脏疾病这两大类疾病。
1、肝胆疾病：比如急性肝损伤、肝硬化等，除谷丙转氨酶、谷草转氨酶，以及转肽酶升高外，甘氨酰脯氨酸二肽氨基肽酶也可能会随之偏高，其中急性肝损伤可伴随尿黄、皮肤发黄、巩膜黄染，肝硬化可伴随食欲减退、腹胀、便秘、乏力等。原发性肝癌和继发性肝癌的患者，甘氨酰脯氨酸二肽氨基肽酶也可能偏高，除此之外，原发性肝癌还可表现为肝区疼痛、腹胀、纳差、乏力，继发性肝癌还可表现为发热、贫血、黄疸、腹水，尤其在继发性肝癌时，其升高程度比原发性肝癌更明显。另外，胆结石、肝内胆汁淤积等也会导致甘氨酰脯氨酸二肽氨基肽酶偏高，其中胆结石可伴随腹痛、发热，肝内胆汁淤积可伴随皮肤瘙痒、黄疸等症状；
2、肾脏疾病：如肾病综合征、慢性肾小球肾炎等，甘氨酰脯氨酸二肽氨基肽酶也会偏高，不仅在血液当中偏高，而且在尿液当中也会偏高，其中肾病综合征可伴随大量蛋白尿、低蛋白血症、水肿、高胆固醇血症，慢性肾小球肾炎可伴随蛋白尿、血尿、高血压、水肿等症状。
甘氨酰脯氨酸二肽氨基肽酶对于临床诊断疾病具有一定的辅助参考意义，特异性比较小，在诊断原发性肝癌时，甲胎蛋白升高的参考意义通常更大，如果是诊断各种原因导致的肝脏损伤，谷丙转氨酶、谷草转氨酶的参考价值相对更大。甘氨酰脯氨酸二肽氨基肽酶偏高的患者，需要及时到医院进行详细检查明确原因，并进行针对性治疗。