剖腹产的后遗症分为短期内出现的后遗症和长期内的远期的并发症，短期内的并发症主要是切口愈合不良、脂肪液化，切口裂开等，还有一些有可能在术后造成肠粘连，严重的时候也有可能会导致肠梗阻，引起消化道的不适的症状。就远期而言，因为剖宫产会造成子宫下段的切口，切口绝大多数情况下会需要1-2年的时间才能够长的比较的坚固。因此如果进行了剖宫产终止妊娠之后，绝大多数都会建议要避孕一年半甚至两年以上，是为了让子宫充分的休息，以免在子宫的瘢痕没有完全愈合的时候再次妊娠，并在孕中晚期的时候发生子宫破裂。
还有一些由于在第二次怀孕的时候，孕囊正好种植在前次手术的剖宫产瘢痕上，属于瘢痕妊娠，也算是异位妊娠的一种。伴随着胎儿和胎盘的逐渐成熟，胎盘有可能会穿透原有的瘢痕，而长在子宫的外面，称之为凶险性的前置胎盘，对于母儿的危害极大。而且还有一些情况，在下次怀孕终止妊娠时，由于前次的瘢痕收缩欠佳，导致短时间之内大量的出血，大大的增加在手术或二次分娩的过程中，由于大出血，而必要外科操作的风险，因此剖宫产有多的可能存在并发症，建议如果可以阴道顺产，还是首选阴道顺产。