淋球菌尿道炎是由于淋球菌感染泌尿系统，导致出现的化脓性炎症，治疗方面以控制淋球菌的感染为主。可以口服对淋球菌敏感的抗生素治疗，如大环内酯类、喹诺酮类、头孢类药物等。
临床治疗淋球菌尿道炎多用阿奇霉素等大环内酯类、环丙沙星等喹诺酮类、头孢曲松等头孢类药物治疗，遵医嘱用药大多可治愈。但此病容易复发，治疗结束后，还需到医院复诊，查前列腺按摩液、尿道或宫颈分泌物，连续2次淋球菌阴性方为治愈。
此外，服药期间一定要按时按量服用，不可自行增减药量，以免细菌产生耐药性。治疗期间除服用药物外，还可以用高锰酸钾溶液清洗会阴部。由于淋病属于性传染病，建议治疗期间停止性生活，性伴侣同时治疗。治疗期间要注意禁止饮酒，少吃辛辣刺激食物，多喝水勤排尿，勤换内裤，做好卫生清洁，避免反复感染。