菊花茶是寒性，因菊花性微寒，所以用菊花冲泡的茶水，整体属性也为寒性。对于多数人而言，短期适量饮用菊花茶，有益于机体健康。但腹泻、机体虚寒等人群，不建议饮用菊花茶。
菊花味甘、苦，性微寒，归肺、肝经。主要有散风清热、平肝明目、清热解毒等功效，可在医生指导下适量饮用，如煎汤内服或冲水泡服等，不仅可以预防机体上火，还能在一定程度上缓解牙龈红肿、咽喉肿痛、体热烦躁等不适。但因为菊花性微寒，所以日常饮用菊花茶需适量，切记不要长期、过量饮用，以免菊花的寒气在体内累积，损伤机体脾胃，破坏机体营卫之气，出现畏冷、四肢发凉、腹痛、腹泻等不适症状，影响机体健康。
日常生活中保存菊花茶时，应当注意环境阴凉、干燥，密闭保存，以防止发生霉变、虫蛀等。若发现菊花茶变质、霉变，需及时丢弃，以免发生误饮变质的菊花茶的情况，产生不适症状。