999感冒清热颗粒和感冒灵颗粒的主要区别如下：
1、999感冒清热颗粒：具有解表散寒的功效，一般用来治疗风寒犯肺引起的风寒感冒，主要成分有荆芥穗、薄荷、防风、柴胡、紫苏叶、葛根、桔梗、苦杏仁、白芷、苦地丁、芦根等，用来治疗风寒犯肺引起的鼻塞、打喷嚏、流清鼻涕、发热比较轻、怕冷比较重、咽痒、咽痒就想咳嗽、咯白稀痰、头痛、全身酸痛、舌淡红、苔薄白、脉浮紧等症状。
2、感冒灵颗粒：一般用来治疗风热犯肺引起的风热感冒，具有清热解表的功效，所含有的成分有三叉苦、岗梅、金盏银盘、薄荷油、野菊花，还有西药马来酸氯苯那敏、咖啡因和对乙酰氨基酚，常用来治疗发热比较重、怕冷比较轻、鼻塞、流黄脓鼻涕、头痛、全身酸痛、咳嗽、咯黄黏痰、痰黏稠不容易咳出来、咽喉肿痛、小便黄、大便干、舌淡红、苔薄黄、脉浮数等风热犯肺引起的风热感冒。
总之，二者不同。