大拇指很短很多时候是因为一种遗传的因素，如果两个大拇指都短，还是因为基因的问题，很多时候是因为父母大拇指可能都比较短，所以导致了自己大拇指可能也比较短，这是基因方面的原因，先天的因素。
当然如果有一只手的大拇指不短，另一只手的大拇指比较短，这个时候有可能是因为小的时候，在骨头生长时骨骺受到了损伤，或者出现了其他的病变导致骨骺损伤，大拇指的骨头增长变慢，最后形成大拇指变短的一种情况。其他的少见因素可能是有一些人得了特殊的疾病，导致骨骺的炎症，骨骺的增殖异常的疾病，导致骨骺缺少了生长的功能，导致大拇指变短，一般情况下大拇指很短的都是以上这些因素。