如果从营养价值来说，鸡蛋和鸭蛋两者并没有明显的营养差别。因为鸡蛋和鸭蛋中都富含蛋白质、磷脂、维生素A、B族维生素，以及钙、钾、铁、磷等矿物质元素。虽然鸭蛋中脂肪、钙、铁等营养物质略高于鸡蛋，但是鸡蛋中维生素A等营养物质略高于鸭蛋，都是适合被机体作为优质蛋白摄入的食材之一，根据个人意愿或需求选择喜欢的品种食用即可。
鸡蛋中含有人体必需的氨基酸，而且鸡蛋中的氨基酸构成与人体相似，相对于鸭蛋更有利于机体的吸收、消化。而且鸡蛋中富含叶黄素、维生素A等营养物质，对于肝病、视力下降等问题的人群，可适量食用。
而鸭蛋的矿物质元素含量比鸡蛋更为丰富，其中的铁元素、钙元素含量要高于鸡蛋，适合处于生长发育期的孩子，以及钙流失较多的老年人食用，对身体有好处。且鸭蛋中卵磷脂含量相对稍高，适量食用可为机体补充营养。
但是排除营养价值，鸡蛋的食用方法、口感、价格等多方面均优于鸭蛋，对不喜欢食用鸡蛋的人群，可以选择鸭蛋等补充营养。注意两者均要煮熟后食用，以免对胃肠道的消化功能产生不良影响，甚至引起食物中毒。无论是鸡蛋还是鸭蛋都要适量食用，长期食用过多，可能会导致胆固醇增高，影响健康。